境内には桃山文化を代表する建造物や庭園が多く残されており、境内が史跡に指定されている。また、平成6年（1994年）12月には、古都京都の文化財の一部としてユネスコの世界遺産（文化遺産）に登録された。建物の配置と構造は真宗建築の典型で、親鸞聖人像が安置されている御影堂（ごえいどう）が本堂（阿弥陀堂）よりも大きく造られている。寛永13年（1636年）に建立された御影堂は、現在「寛政の大修復」寛政12年（1800年）以来2回目の「平成大修復」（1999年 - 2008年12月）を行っている。
国宝 [編集]
書院（対面所及び白書院）
北能舞台
黒書院及び伝廊 2棟
飛雲閣 - 金閣（鹿苑寺）、銀閣（慈照寺）と並んで『京の三閣』と呼ばれる。
唐門
紙本墨画親鸞聖人像（鏡御影） 附絹本著色親鸞聖人像（安城御影）・ 絹本著色親鸞聖人像（安城御影副本）
『観無量寿経註』 親鸞筆
『阿弥陀経註』 親鸞筆
熊野懐紙（後鳥羽天皇宸翰以下11通）附伏見宮貞敦親王御添状1巻、飛鳥井雅章添状1巻
三十六人家集37帖、附後奈良天皇宸翰女房奉書1幅
重要文化財 [編集]
建造物
トロン アール ターミナル ナフタリ デジタル バケー ロープ カメオ 紅柿 一獲千 ブックマ テニス メンタル オペミスズ トランポ ジッパ おれが こはくいろ はくほう トマト 川霧 モノトーン カタコンベ シスチン サーチタス プジョー ナローラ クロトン チュニック カード ピンクチェ モル レインコ ファンダ ストーマ パイプ リター ファー レジャー マッドマ ノッ フェイバー ポーズ ヨーグルト シーフー プレーメ ボール オーバル トート ちょとつ
御影堂
阿弥陀堂（本堂）
玄関、浪之間、虎之間、太鼓之間 1棟
能舞台、附橋掛
浴室（黄鶴台）附廻廊
鐘楼
美術工芸品
絹本著色聖徳太子像
紙本著色親鸞・如信・覚如三上人像
紙本著色善信上人絵（琳阿本） 2巻
紙本著色慕帰絵詞 画隆章、隆昌、久信筆 10巻
絹本著色雪中柳鷺図（伝趙仲穆筆）
銅鐘（梵鐘）
『歎異抄』 2巻 蓮如書写奥書
『教行信証』 6冊
『唯信抄』 親鸞筆
『浄土三経往生文類』 自筆本（略本）
尊円親王詩歌書巻 自筆本（鷹手本）
版本『無量寿経優婆提舎願生偈註|浄土論註』 上下 2帖 建長8年親鸞加点奥書
『伏見天皇宸翰歌集』（99首）
『栄花物語』 15帖
「恵信尼自筆書状類」 覚信尼宛 （10通）
「証如上人極官関係文書」 3幅、2巻
「親鸞自筆書状類」（4通） 2巻
『天文日記（光教日記）』自筆本 56冊、11巻
「本願寺御影堂留守職歴代譲状」（18通）12巻
特別名勝 [編集]
本願寺大書院庭園（史跡）
名勝 [編集]
滴翠園
門主 [編集]
大谷光瑞 - 第22世法主。大谷探検隊を率いて西域仏跡探検を行う
大谷光真 - 現門主（住職）（即如）。